La Facultad de Ciencias está integrada por cerca de 50 laboratorios, distribución en la cual se destacan sus museos y centros especializados, que atienden diversas áreas del conocimiento, entre las que se destacan: Biociencias, Física, Geociencias y Química. Estos espacios cuentan con infraestructura física y equipos en constante actualización, respondiendo a las exigencias del medio y al avance tecnológico. A esto se suma la experiencia y trayectoria de nuestros investigadores, quienes soportan el desarrollo de actividades de docencia, investigación y extensión, siempre al servicio de la sociedad colombiana.

1. La Facultad de Ciencias cuenta con una sólida infraestructura de laboratorios y museos especializados en el área de las biociencias, dedicados al estudio de la vida en todas sus formas y niveles de organización. Estos espacios apoyan la investigación, docencia y extensión en disciplinas como la biología molecular y celular, la microbiología, la ecología, la genética, la fisiología de insectos, la biotecnología y la paleoecología, así como la conservación y catalogación de la biodiversidad a través de colecciones vivas y patrimoniales. Entre ellos se destacan el Centro Apícola, el Herbario Gabriel Gutiérrez Medel, el Museo Entomológico Francisco Luis Gallego y el Museo Micológico, junto a una amplia red de laboratorios que impulsan el avance científico y la formación de nuevos investigadores.
2. La Facultad de Ciencias dispone de una variada y moderna infraestructura de laboratorios en el área de la física, orientados a la investigación, la docencia y la aplicación práctica del conocimiento. Estos espacios abarcan campos como la mecánica, la óptica, la física moderna, la fotónica, la espectroscopía y la física radiológica, así como áreas interdisciplinarias como la biofísica, el bioanálisis, el diseño mecánico y la instrumentación electrónica aplicada a la agricultura. Entre ellos se encuentran el Laboratorio de Láseres y Espectroscopía, el Laboratorio de Fotónica, el Laboratorio de Física Mecánica y el Laboratorio de Óptica, entre otros, que fortalecen la formación científica y promueven el desarrollo tecnológico.
3. La Facultad de Ciencias cuenta con laboratorios especializados en geociencias, dedicados al estudio de la composición, formación y conservación de los suelos, así como al análisis de sistemas naturales y sus interacciones. Estos espacios permiten desarrollar investigaciones en campos como la génesis del suelo, la física y conservación de su estructura, y el estudio de sistemas complejos, aportando herramientas clave para la gestión sostenible de los recursos naturales y el entendimiento de los procesos terrestres. Entre ellos se destacan el Laboratorio de Suelos, el Laboratorio de Génesis del Suelo, el Laboratorio de Física y Conservación de Suelos y el Laboratorio de Sistemas Complejos.
4. La Facultad de Ciencias dispone de una amplia red de laboratorios de química orientados a la investigación, la docencia y el desarrollo de soluciones innovadoras para diversos sectores. Estos espacios abarcan campos como la química orgánica e inorgánica, la fisicoquímica, la bioquímica, la ciencia de los alimentos y el análisis ambiental, así como áreas especializadas en productos naturales, bioconversiones y venenos naturales. Entre sus instalaciones se encuentran el Laboratorio de Análisis Instrumental, el Laboratorio de Química Analítica, el Laboratorio de Productos Naturales y el Laboratorio de Química Orgánica, entre otros, que fortalecen la formación académica y el avance científico en las ciencias químicas.